三花猫并不都是母猫，但母猫的比例确实远高于公猫。这是因为三花猫的毛色遗传与性别相关，主要是由猫的性染色体决定的。
首先，控制猫毛颜色和性别的是同一对XY染色体。其中X染色体携带颜色且一条X染色体只能携带两种颜色，Y染色体则没有颜色。由于母猫的染色体为XX，所以母猫能从父母那里获得两种不同的颜色基因，从而表现出三色（通常指黑色、橘色和白色）的毛色。
然而，公猫的染色体为XY，只能从母亲那里获得一种颜色基因，因此公猫通常只表现出两种颜色的毛色。虽然也有公的三花猫存在，但这是由于染色体异变（如XXY）而产生的，这种变异会导致猫咪具有先天缺陷，即克氏综合征（也叫猫咪无精症），使其无法生育后代。
因此，虽然三花猫并不都是母猫，但母猫的比例远高于公猫，这主要是由猫的性染色体和毛色遗传规律所决定的。